Vialli logró llevar el equipo a ganar su segunda FA Cup en cuatro años -esta vez derrotaron al Aston Villa en la final y con Di Matteo contribuyendo de nuevo en el marcador, el cual acabó 1-0- en la última final disputada en el Estadio de Wembley antes de su remodelación. Se clasifica para la Liga Europa de la UEFA por decimoquinta vez.
Con este propósito, hizo una renovación profunda en la plantilla y el cuerpo técnico. El objetivo es llegar a ser una empresa con cero emisiones de carbono y cero residuos. Venables, Graham y Murray fueron vendidos la temporada siguiente, mientras que el escocés Charlie Cooke se unió al equipo por £72 000, al igual que Tommy Baldwin, quien llegó de intercambio por Graham. Carlos Castellanos, que trajo el primer balón a Bilbao, fue su primer presidente.
